Kondisi lapangan Joko Samudro yang tidak kompeten kembali memakan korban, Paulo Victor harus mandi lebih cepat karena mengalami cedera.
Striker Persebaya itu kemudian digantikan oleh Michael Rumere pada menit ke-37.
Skor imbang 0-0 menutup babak pertama.
Perubahan dilakukan coach Aji Santoso dengan memasukkan Ahmad Nufiandani dan Denny Agus pada babak kedua.
Baca Juga: Mendidih Bentrok Shin Tae-yong dan Thomas Doll, PSSI Perparah Keadaan dengan Tak Lakukan Komunikasi
Persebaya langsung menggebrak lewat peluang beruntun dari Rumere, Nufiandani, dan Ze Valente namun tak membuahkan gol.
Pesut Etam justru mampu mencuri gol lewat Matheus Pato yang meneruskan umpan Agung Prasetyo pada menit ke-56.
Pergantian langsung dilakukan Borneo FC yang ingin menjaga kedudukan dengan memasukkan tiga pemain bertahan Fajar Fathurrahman, Wahyudi Hamisi, dan Leo Guntara.
Tim tuan rumah mampu menyeimbangkan kedudukan lewat gol Sho Yamamoto pada menit ke-79.
Persebaya bahkan berbalik unggul setelah Alta Ballah mencetak gol pada menit ke-81 usai meneruskan umpan Michael Rumere.